पॉलिपेप्टाइड पेप्टाइड साखळीचे डिझाइन योजना आणि समाधान

I. सारांश
पेप्टाइड्स हे विशेष मॅक्रोमोलेक्यूल्स आहेत जसे की त्यांचे अनुक्रम त्यांच्या रासायनिक आणि भौतिक वैशिष्ट्यांमध्ये असामान्य आहेत.काही पेप्टाइड्सचे संश्लेषण करणे कठीण असते, तर काहींचे संश्लेषण करणे तुलनेने सोपे असते परंतु शुद्ध करणे कठीण असते.व्यावहारिक समस्या अशी आहे की बहुतेक पेप्टाइड्स जलीय द्रावणात किंचित विरघळतात, म्हणून आपल्या शुद्धीकरणामध्ये, हायड्रोफोबिक पेप्टाइडचा संबंधित भाग जलीय विद्राव्यांमध्ये विरघळलेला असणे आवश्यक आहे, म्हणून, हे सॉल्व्हेंट्स किंवा बफर वापरण्यास गंभीरपणे विसंगत असण्याची शक्यता आहे. जैविक प्रायोगिक प्रक्रियेचे, जेणेकरुन तंत्रज्ञांना त्यांच्या स्वतःच्या हेतूसाठी पेप्टाइड वापरण्यास सक्त मनाई आहे, जेणेकरून संशोधकांसाठी पेप्टाइड्सच्या डिझाइनचे अनेक पैलू खालीलप्रमाणे आहेत.

पॉलिपेप्टाइड पेप्टाइड साखळीचे डिझाइन योजना आणि समाधान
दुसरे, कृत्रिम कठीण पेप्टाइड्सची योग्य निवड
1. खाली-नियमित अनुक्रमांची एकूण लांबी
15 पेक्षा कमी अवशेषांचे पेप्टाइड्स मिळवणे सोपे आहे कारण पेप्टाइडचा आकार वाढतो आणि क्रूड उत्पादनाची शुद्धता कमी होते.पेप्टाइड साखळीची एकूण लांबी 20 अवशेषांच्या पलीकडे वाढत असल्याने, उत्पादनाचे अचूक प्रमाण ही मुख्य चिंता आहे.अनेक प्रयोगांमध्ये, अवशेषांची संख्या 20 पेक्षा कमी करून अनपेक्षित प्रभाव प्राप्त करणे सोपे आहे.
2. हायड्रोफोबिक अवशेषांची संख्या कमी करा
हायड्रोफोबिक अवशेषांचे मोठे प्राबल्य असलेले पेप्टाइड्स, विशेषत: सी-टर्मिनसच्या 7-12 अवशेषांमध्ये, सहसा कृत्रिम अडचणी निर्माण करतात.हे एक अपुरे संयोजन म्हणून पाहिले जाते कारण संश्लेषणात बी-फोल्ड शीट मिळते."अशा प्रकरणांमध्ये, दोनपेक्षा जास्त सकारात्मक आणि नकारात्मक अवशेषांचे रूपांतर करणे किंवा पेप्टाइड रचना अनलॉक करण्यासाठी पेप्टाइडमध्ये ग्लाय किंवा प्रो घालणे उपयुक्त ठरू शकते."
3. "कठीण" अवशेषांचे नियमन
"अनेक Cys, Met, Arg आणि Try अवशेष आहेत जे सहसा सहजपणे संश्लेषित केले जात नाहीत."Ser चा वापर सामान्यतः Cys साठी नॉनऑक्सिडेटिव्ह पर्याय म्हणून केला जाईल.
पॉलिपेप्टाइड पेप्टाइड साखळीचे डिझाइन योजना आणि समाधान

तिसरे, पाण्यात विरघळणारी योग्य निवड सुधारा
1. N किंवा C टर्मिनस समायोजित करा
अम्लीय पेप्टाइड्सच्या सापेक्ष (म्हणजे, pH 7 वर ऋण आकारले जाते), ऍसिटिलेशन (N-टर्मिनस ऍसिटिलेशन, C टर्मिनस नेहमी मुक्त कार्बोक्झिल गट राखून) नकारात्मक चार्ज वाढवण्यासाठी विशेषतः शिफारस केली जाते.तथापि, मूलभूत पेप्टाइड्ससाठी (म्हणजे, pH 7 वर सकारात्मक शुल्क आकारले जाते), अॅमिनेशन (एन-टर्मिनसवर विनामूल्य अमीनो गट आणि सी-टर्मिनसवर अॅमिनेशन) विशेषतः सकारात्मक चार्ज वाढवण्याची शिफारस केली जाते.

2. क्रम मोठ्या प्रमाणात लहान करा किंवा वाढवा

काही क्रमांमध्ये Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr आणि Ala इत्यादी मोठ्या प्रमाणात हायड्रोफोबिक अमीनो ऍसिड असतात. जेव्हा हे हायड्रोफोबिक अवशेष 50% पेक्षा जास्त असतात तेव्हा ते विरघळणे सहसा सोपे नसते.पेप्टाइडचे सकारात्मक आणि नकारात्मक ध्रुव आणखी वाढवण्यासाठी अनुक्रम वाढवणे उपयुक्त ठरू शकते.दुसरा पर्याय म्हणजे हायड्रोफोबिक अवशेषांचे नियमन करून सकारात्मक आणि नकारात्मक ध्रुव वाढवण्यासाठी पेप्टाइड साखळीचा आकार कमी करणे.पेप्टाइड साखळीच्या सकारात्मक आणि नकारात्मक बाजू जितक्या मजबूत असतील तितकी पाण्याशी प्रतिक्रिया होण्याची शक्यता जास्त असते.
3. पाण्यात विरघळणारे अवशेष ठेवा
काही पेप्टाइड चेनसाठी, काही सकारात्मक आणि नकारात्मक अमीनो ऍसिडचे संयोजन पाण्याची विद्राव्यता सुधारू शकते.आमची कंपनी अम्लीय पेप्टाइड्सच्या एन-टर्मिनस किंवा सी-टर्मिनसची ग्लू-ग्लूसोबत जोडण्याची शिफारस करते.मूलभूत पेप्टाइडचे N किंवा C टर्मिनस दिले गेले आणि नंतर Lys-Lys.जर चार्ज केलेला ग्रुप ठेवता येत नसेल, तर Ser-Gly-Ser ला N किंवा C टर्मिनसमध्ये देखील ठेवता येईल.तथापि, जेव्हा पेप्टाइड साखळीच्या बाजू बदलल्या जाऊ शकत नाहीत तेव्हा हा दृष्टीकोन कार्य करत नाही.