ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड्सचे अनेक प्रकार आहेत आणि त्यांचे वर्गीकरण भौतिक आणि रासायनिक गुणधर्म, स्त्रोत, अंतर्ग्रहण यंत्रणा आणि बायोमेडिकल अनुप्रयोगांवर आधारित आहे.त्यांच्या भौतिक आणि रासायनिक गुणधर्मांनुसार, मेम्ब्रेन भेदक पेप्टाइड्स तीन प्रकारांमध्ये विभागले जाऊ शकतात: cationic, amphiphilic आणि hydrophobic.कॅशनिक आणि अॅम्फिफिलिक मेम्ब्रेन भेदक पेप्टाइड्सचा वाटा 85% आहे, तर हायड्रोफोबिक मेम्ब्रेन भेदक पेप्टाइड्सचा वाटा फक्त 15% आहे.
1. कॅशनिक मेम्ब्रेन भेदक पेप्टाइड
Cationic transmembrane peptides हे TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 आणि DPV6 सारख्या आर्जिनिन, लाइसिन आणि हिस्टिडाइनने समृद्ध असलेल्या लहान पेप्टाइड्सचे बनलेले असतात.त्यापैकी, आर्जिनिनमध्ये ग्वानिडाइन असते, जे सेल झिल्लीवर नकारात्मक चार्ज केलेल्या फॉस्फोरिक ऍसिड गटांसह हायड्रोजन बंध बनवू शकते आणि शारीरिक PH मूल्याच्या स्थितीनुसार झिल्लीमध्ये ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड्स मध्यस्थी करू शकते.ऑलिगार्गिनिनच्या अभ्यासातून (3 आर ते 12 आर पर्यंत) असे दिसून आले की झिल्ली प्रवेश क्षमता केवळ तेव्हाच प्राप्त होते जेव्हा आर्जिनिनचे प्रमाण 8 इतके कमी होते आणि आर्जिनिनचे प्रमाण वाढल्याने पडदा प्रवेश करण्याची क्षमता हळूहळू वाढते.लायसिन, जरी आर्जिनिनसारखे कॅशनिक असले तरी, त्यात ग्वानिडाइन नसते, म्हणून जेव्हा ते एकटे असते तेव्हा त्याची पडदा प्रवेश क्षमता फार जास्त नसते.Futaki et al.(2001) असे आढळले की चांगला पडदा प्रवेश प्रभाव तेव्हाच प्राप्त होऊ शकतो जेव्हा कॅशनिक सेल मेम्ब्रेन भेदक पेप्टाइडमध्ये कमीतकमी 8 सकारात्मक चार्ज केलेले अमीनो ऍसिड असते.जरी सकारात्मक चार्ज केलेले अमीनो ऍसिडचे अवशेष भेदक पेप्टाइड्स झिल्लीमध्ये प्रवेश करण्यासाठी आवश्यक असले तरी, इतर अमीनो ऍसिड देखील तितकेच महत्त्वाचे आहेत, जसे की W14 F मध्ये बदलते तेव्हा पेनेट्रेटिनची भेदकता नष्ट होते.
कॅशनिक ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड्सचा एक विशेष वर्ग म्हणजे न्यूक्लियर लोकॅलायझेशन सीक्वेन्स (NLSs), ज्यामध्ये आर्जिनिन, लाइसिन आणि प्रोलाइनने समृद्ध असलेले लहान पेप्टाइड्स असतात आणि न्यूक्लियसमध्ये न्यूक्लियसमध्ये आणले जाऊ शकतात.NLSs ची पुढील एकल आणि दुहेरी टायपिंगमध्ये विभागणी केली जाऊ शकते, ज्यात अनुक्रमे मूलभूत अमीनो ऍसिडचे एक आणि दोन क्लस्टर असतात.उदाहरणार्थ, सिमियन व्हायरस 40(SV40) मधील PKKKRKV हे सिंगल टायपिंग NLS आहे, तर न्यूक्लियर प्रोटीन हे डबल टायपिंग NLS आहे.KRPAATKKAGQAKKKL हा एक लहान क्रम आहे जो झिल्लीच्या ट्रान्समेम्ब्रेनमध्ये भूमिका बजावू शकतो.बहुतेक NLS ची चार्ज संख्या 8 पेक्षा कमी असल्याने, NLSs प्रभावी ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड्स नसतात, परंतु जेव्हा हायड्रोफोबिक पेप्टाइड अनुक्रमांशी सहसंयोजकपणे अॅम्फिफिलिक ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड्स तयार होतात तेव्हा ते प्रभावी ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड्स असू शकतात.
2. एम्फिफिलिक ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड
अॅम्फिफिलिक ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड्समध्ये हायड्रोफिलिक आणि हायड्रोफोबिक डोमेन असतात, ज्यांना प्राथमिक अॅम्फिफिलिक, दुय्यम α-हेलिकल अॅम्फिफिलिक, β-फोल्डिंग अॅम्फिफिलिक आणि प्रोलिन-समृद्ध अॅम्फिफिलिकमध्ये विभागले जाऊ शकते.
प्राथमिक प्रकारचे अॅम्फिफिलिक वेअर मेम्ब्रेन पेप्टाइड्स दोन श्रेणींमध्ये विभागलेले आहेत, एनएलएस सह श्रेणी हायड्रोफोबिक पेप्टाइड अनुक्रमाने सहसंयोजितपणे जोडलेली आहे, जसे की MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) आणि Pep - 1 (KETWWETWTEWTEWTEWSQVKRK04KVKLK04KVKalk वर आधारित दोन्ही चिन्हे), स्थानिक , ज्यामध्ये हायड्रोफोबिक MPG चे डोमेन एचआयव्ही ग्लायकोप्रोटीन 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A) च्या फ्यूजन अनुक्रमाशी संबंधित आहे आणि Pep-1 चे हायड्रोफोबिक डोमेन उच्च झिल्ली आत्मीयतेसह (KETWWET WWTEW) ट्रायप्टोफॅन रिच क्लस्टरशी संबंधित आहे.तथापि, दोन्हीचे हायड्रोफोबिक डोमेन WSQP द्वारे आण्विक स्थानिकीकरण सिग्नल PKKKRKV शी जोडलेले आहेत.प्राथमिक एम्फिफिलिक ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड्सचा आणखी एक वर्ग नैसर्गिक प्रथिनांपासून वेगळा होता, जसे की pVEC, ARF(1-22) आणि BPrPr(1-28).
दुय्यम α-helical amphiphilic transmembrane peptides α-helices द्वारे पडद्याला बांधतात आणि त्यांचे हायड्रोफिलिक आणि हायड्रोफोबिक अमीनो ऍसिड अवशेष हेलिकल संरचनेच्या वेगवेगळ्या पृष्ठभागावर असतात, जसे की MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).बीटा पेप्टाइड फोल्डिंग प्रकार अॅम्फिफिलिक वेअर मेम्ब्रेनसाठी, बीटा प्लीटेड शीट तयार करण्याची क्षमता त्याच्या पडद्याच्या आत प्रवेश करण्याच्या क्षमतेसाठी महत्त्वपूर्ण आहे, जसे की VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) मध्ये, झिल्लीच्या प्रवेश क्षमतेच्या संशोधनाच्या प्रक्रियेत, डी मेम्ब्रेनचा वापर करून. - अमीनो ऍसिड उत्परिवर्तन एनालॉग्स बीटा दुमडलेला तुकडा तयार करू शकत नाहीत, पडद्याची प्रवेश क्षमता खूपच खराब आहे.प्रोलाइन-समृद्ध अॅम्फिफिलिक ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड्समध्ये, पॉलीप्रोलिन II (PPII) शुद्ध पाण्यात सहजपणे तयार होते जेव्हा प्रोलाइन पॉलीपेप्टाइड रचनेत अत्यंत समृद्ध असते.PPII हे डाव्या हाताचे हेलिक्स आहे ज्यामध्ये प्रति वळण 3.0 एमिनो अॅसिड अवशेष आहेत, मानक उजव्या हाताच्या अल्फा-हेलिक्स रचनेच्या विरूद्ध 3.6 प्रति वळण एमिनो अॅसिड अवशेष आहेत.प्रोलाइन-समृद्ध अॅम्फिफिलिक ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड्समध्ये बोवाइन अँटीमाइक्रोबियल पेप्टाइड 7(Bac7), सिंथेटिक पॉलीपेप्टाइड (PPR)n (n 3, 4, 5 आणि 6 असू शकतात) इत्यादींचा समावेश होतो.
3. हायड्रोफोबिक झिल्ली भेदक पेप्टाइड
हायड्रोफोबिक ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड्समध्ये केवळ नॉन-ध्रुवीय अमीनो ऍसिडचे अवशेष असतात, ज्याचा निव्वळ चार्ज अमीनो ऍसिड अनुक्रमाच्या एकूण चार्जच्या 20% पेक्षा कमी असतो किंवा ट्रान्समेम्ब्रेनसाठी आवश्यक असलेले हायड्रोफोबिक भाग किंवा रासायनिक गट असतात.या सेल्युलर ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड्सकडे अनेकदा दुर्लक्ष केले जात असले तरी, ते अस्तित्वात आहेत, जसे की फायब्रोब्लास्ट ग्रोथ फॅक्टर (K-FGF) आणि कपोसीच्या सारकोमापासून फायब्रोब्लास्ट ग्रोथ फॅक्टर 12 (F-GF12).
पोस्ट वेळ: मार्च-19-2023